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  1. 有谁在RCSB PDB网站下载过蛋白质的pdb文件?怎样从这个网站中 …

    Apr 7, 2015 · 在最基本的层面上,pdb 文件是原子和笛卡尔 (xyz) 坐标的列表。相同的格式可用于表示任何物理对象。 相同的格式可用于表示任何物理对象。 包含其他信息以提供有关原子的 …

  2. 有没有生物大佬教教我PDB是什么啊?在线等,挺急的!!谢谢 …

    Feb 22, 2020 · PDB,全称为Protein Data Bank,该机构坐落于我课题组所在的办公楼——蛋白楼,他们的办公室位于蛋白楼一楼。 蛋白楼,一楼即为PDB办公地点 走进办公楼的大门,便可 …

  3. pdb文件如何打开? - 知乎

    在对PDB(.pdb)文件进行操作时,有时仅需要保留蛋白链、核酸链、配体、或者水。除了直接在文本文档格式下或者coot中对PDB文件中其他信息进行删除,还可以通过命令行的形式来提 …

  4. 请问已知蓝色绿色两个蛋白的pdb文件,怎么用pymol画出这样的 …

    如果两个蛋白的序列同源性高,直接用pymol自带的alignment功能,打开两个PDB 文件,然后用Action菜单(点右边那个大写的A)下的align to选项把俩蛋白摞起来。

  5. 如何获得一个蛋白质的PDB编号? - 知乎

    1)我想知道一个蛋白质的空间结构,想查查pdb,但是不知道编号。 这个好办,不需要知道pdb编号。直接查蛋白质的名字,其他通用的ID就行了。一个蛋白质,视重要程度和实验难度,可能 …

  6. pymol如何保存成pdb格式? - 知乎

    pdb格式与大多数表示分子三维结构的文件格式有所不同,最主要的区别是其对 列 的格式要求。 pdb规定一共有80列,对每一列的信息都做了严格的规定,如1-4列为“ATOM”这四个字母(在 …

  7. pdb是什么文件格式? - 知乎

    pdb 文件的使用. 使用 pdb 文件可以模拟微观分子的视觉表示。除此之外,pdb 文件还用于模拟对接,因此研究人员可以确定例如两个分子如何相互作用。科学家可以观察癌细胞的表面蛋白, …

  8. 米内和上海医工院PDB(医药地理)哪个医药数据库更好? - 知乎

    pdb:地区机构、技术文件、学术会议、技术报告医疗官网、专利、商标、、文献期刊等。 药融云:全球各国药品监管机构、文献期刊、异构资源、企业公告、试验研究、学术会议报告、各国 …

  9. 从 Alphafold 蛋白质结构数据库下载 PDB文件 - 知乎

    Oct 29, 2021 · 如何从 alphafold2 蛋白质数据库下载 pdb。AlphaFold 是由谷歌的 DeepMind 开发的人工智能程序,用于预测蛋白质结构。

  10. 在数据库中蛋白质结构搜索? - 知乎

    04. 其他相关数据库. 1)HMDB:人类代谢组数据库( https:// hmdb.ca/ )于2007年首次发布,被认为是人类代谢研究的标准代谢组学资源,包含有关人类代谢物及其生物学作用、生理浓度、 …

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